Če je sprememba sumljiva za kožni melanom, je priporočena popolna kirurška odstranitev spremembe z ozkim varnostnim robom zdrave kože. Tak poseg imenujemo ekscizijska biopsija.
Gre za manjši kirurški poseg, ki se običajno opravi v lokalni anesteziji. Namen ekscizijske biopsije ni le odstranitev sumljive spremembe, temveč predvsem pridobitev celotnega vzorca tkiva za natančno histopatološko analizo.
Delna biopsija pigmentnih sprememb praviloma ni priporočljiva, saj lahko oteži natančno oceno debeline melanoma in drugih pomembnih histopatoloških značilnosti. Izjema so zelo velike spremembe ali lokalizacije, kjer popolna odstranitev ob prvem posegu ni izvedljiva.